Cientos de agentes antidisturbios avanzaron para dispersar a los activistas que se encontraban en un paso subterráneo cerca de la sede del gobierno de la ciudad.
Los policías se enfrentaron a los manifestantes e hicieron uso de espray pimienta.
Varias personas resultaron heridas y decenas de manifestantes fueron detenidos.
Durante una sesión informativa antes de los choques, la policía señaló que debía desalojar el paso de Lung Wo por tratarse de una vía pública importante.
Es el tercer día del operativo policial que según las fuerzas de seguridad, es necesario para aliviar el caos de tráfico pero que -insisten- no tienen como objetivo expulsar a los manifestantes.
Un portavoz de la policía, Tsui Wai-Hung, confirmó que 37 hombres y ocho mujeres fueron arrestados por "asamblea ilegal".
El funcionario insistió en que los detenidos no resultaron heridos pero imágenes de televisoras locales mostraron a unos agentes de policía golpeando a un manifestante.
Los manifestantes, una mezcla de estudiantes y activistas de un grupo llamado Occupy Central, ocupan desde hace días puntos clave de Hong Kong, en demanda de que las próximas elecciones en el territorio sean completamente democráticas.
China, que tiene control sobre Hong Kong, dice que los residentes pueden votar, pero que rivsará los candidatos que son elegibles.
Es la tercera semana de acción por parte de los activistas, que pretenden presionar a las autoridades de China y Hong Kong para que respondan a sus demandas de reforma.
Miles de personas salieron a las calles al comienzo de las protestas pero las cifras se han reducido en los últimos días.
El pasado fin de semana, el líder de Hong Kong, CY Leung, dijo que los manifestantes no tienen ninguna posibilidad de cambiar la postura de Pekín sobre una reforma constitucional y añadió que las protestas están fuera de control.